Alaca Mustafa Paşa Camii, tarihi boyunca birçok efsane ve rivayete ev sahipliği yapmış önemli bir yapıdır. Yapım tarihi kesin olarak bilinmemekle birlikte, caminin köklü geçmişi, Osmanlı İmparatorluğu'nun Trakya'daki fetihleriyle ilişkilendirilir. Akıncılar döneminin izlerini taşıyan bu yapı, hem mimari özellikleri hem de tarihi değeriyle dikkat çekmektedir. Zaman içinde çeşitli restorasyonlar geçiren cami, günümüzde yeniden ibadete açılmıştır.

Alaca Mustafa Paşa Camii'nin yapım tarihi kesin olarak bilinmemektedir, çünkü caminin orijinal kitabesi günümüze ulaşamamıştır. Bazı kaynaklar ve araştırmacılar, caminin 15. yüzyılda, Osmanlı'nın Trakya üzerinden Rumeli'ye akınlar düzenlediği ilk dönemlerde, akıncı beylerinden Akıncı Mustafa Paşa tarafından yaptırıldığını belirtmektedir. 2020 yılında Vakıflar Bölge Müdürlüğü tarafından yapılan restorasyon çalışmalarıyla cami ibadete yeniden açılmıştır.