Çavdarlı Köyü, Afyonkarahisar'ın tarihi derinliklerine sahip, köklü bir yerleşim alanıdır. Osmanlı dönemine uzanan geçmişiyle, köyün adı ve yerleşim yapısı, bölgedeki tarımsal faaliyetlerin ve göçlerin izlerini taşımaktadır. Geçmişten günümüze, farklı kültürlerin etkileşim içinde yaşadığı bu köy, sadece doğal güzellikleriyle değil, aynı zamanda tarihi dokusuyla da dikkat çekmektedir.

Afyonkarahisar'daki Çavdarlı Köyü'nün tarihi ile ilgili şu bilgiler bulundu:

• Adının kökeni. Yapılan incelemeler ve araştırmalara göre, Çavdarlı köyünün şu anki adını, Osmanlı Devleti zamanında bölgenin çavdar ihtiyacını karşılayan bir bölge olması nedeniyle almıştır.
• İlk yerleşimler. Köyün olduğu yerlerde, 1400-1550 yılları arasında Orta Asya'dan gelen Yörük beylerinin çadırlarını kurduğu ve bir süre konakladıktan sonra göçlerini toplayıp, İç Anadolu'dan ayrıldıkları yerler olduğu saptanmıştır.
• Yerleşik düzen. 1700-1750 yılları arasında yerleşik düzene geçilmiş, bölgeye Yozgat, Sivas ve Emirdağ yöresinden çok sayıda göçler olmuştur.

Ayrıca, bazı söylentilere göre Çavdarlı adının, İlhanlılar döneminde Anadolu'ya gelen Moğolların bir kolu olan ve Ankara-Eskişehir arasında yaşamış olan Çavdar Tatarlarından geldiği tahmin edilmektedir. Bir başka söylentiye göre ise köy, adını Anadolu Selçuklu Devleti'nin İlhanlıların egemenliği altına girdiği dönemde bu bölgeye yerleşen bir boyun önderi olan Almak Noyan'ın oğlu Çavdar Bey'den almıştır.